リソース（例えば/sitecore内など）に保存されているアイテムをパブリッシュすると、ターゲット データベース内の非リソース アイテムがすべて削除される可能性があります。これは、ターゲット データベースに、リソース アイテムをオーバーライドするアイテム バージョンが含まれている場合（例えば、/sitecoreアイテムがターゲット データベースで編集されていた場合など）に発生します。
この問題を解決するには、貴社のインスタンスをSitecore 10.3にアップグレードしてください。
この問題の影響を緩和するには、ターゲット データベース上でcleanupコマンドを実行し、デフォルトのリソース アイテムをオーバーライドするアイテムを削除してください。
さらなる詳細につきましては、以下の記事をご参照ください。
https://doc.sitecore.com/xp/en/developers/101/developer-tools/the-cli-itemres-command.html#the-cleanup-subcommand